Связь между статусом вакцинации, типом и временем после вакцинации с идентичностью происхождения во время появления новых вариантов SARS-CoV-2

В недавнем исследовании, опубликованном в Emerging Infectious Diseases , исследователи оценили связь между штаммами коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома 2 (SARS-CoV-2) и возрастом пациента, статусом вакцинации против коронавирусной болезни 2019 (COVID-19), типом вакцины и прошедшими днями. с момента последней вакцинации жителей Нью-Йорка.

Фон

Исследования показали более высокую трансмиссивность и способность уклоняться от иммунитета новых штаммов SARS-CoV-2, таких как Omicron и Delta, по сравнению с ранее циркулировавшими штаммами. Увеличение числа мутаций в последних штаммах значительно повышает инфекционность и ослабляет иммунную защиту, обеспечиваемую существующими вакцинами против COVID-19, моноклональными антителами (мАт) и переливанием сыворотки выздоравливающих. Такие факторы, как возраст пациента, тип, статус вакцинации и продолжительность, прошедшая с момента последней вакцинации, также могут влиять на эффективность вакцины против COVID- 19 .

Об исследовании

В настоящем исследовании случай-контроль исследователи провели сопоставленный анализ случай-контроль, чтобы оценить различия в эффективности вакцин против штаммов SARS-CoV-2, таких как Delta и Omicron, связанные с различиями в статусе вакцинации, типе вакцины, времени после вакцинации и возраст пациентов среди жителей Нью-Йорка.

Для анализа был использован набор данных о геномной последовательности вируса, связанный с демографическими данными и данными о вакцинации, полученными из записей электронной системы наблюдения за инфекционными заболеваниями и информационной системы иммунизации штата Нью-Йорк, соответственно. В группу больных вошли лица, инфицированные новым штаммом SARS-CoV-2, тогда как в контрольную группу вошли лица, инфицированные любым другим штаммом SARS-CoV-2.

Респираторные мазки, которые были признаны положительными по SARS-CoV-2 с помощью полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией в режиме реального времени (RT-PCR), были подвергнуты анализу полногеномного секвенирования (WGS) на основе глобальной инициативы по обмену всеми данными о гриппе ( GISAID) последовательности базы данных. Человек считался невакцинированным, если образец был получен до вакцинации против COVID-19, вакцинированным, если образец был получен более чем через 2 недели после завершения первичной вакцинации (первоначальная доза вакцины Janssen и последующая доза вакцины Moderna или Pfizer), и ревакцинированным, если образец был получен в любое время после введения бустерной дозы любого типа вакцины против COVID-19.

Появление Omicron было проанализировано в период с 28 ноября 2021 г. по 24 января 2022 г., включая 1439 пациентов (лиц с инфекциями Omicron) и 728 контрольных пациентов (лица с вариантами Delta, B.1.617.2 или штаммами AY). Пациенты из группы сравнения были сопоставлены с контрольной группой на основе даты сбора образца (±6 дней), местоположения (экономические районы штата Нью-Йорк), пола пациента и возраста.

Появление дельты было проанализировано в период с 19 марта 2021 г. по 15 августа 2021 г. с участием 603 больных и 1816 контрольных пациентов соответственно. Контрольную группу составили лица, инфицированные B.1.1.7 и Q.4 Alpha (62%), B.1.526 Iota (20%), P.1.X Gamma (3,5%) и B.1.351.X Beta ( 1,0%). Моделирование логистической регрессии использовалось с моделями, выбранными на основе оценок информационного критерия Акаике (AIC), и были рассчитаны отношения шансов (OR).

Группа исключила 261 частично вакцинированного человека (образцы которых были получены в период между первой дозой и двумя неделями после завершения вакцинации Moderna (n = 90) или Pfizer (n = 171). Кроме того, были исключены лица, у которых были получили бустерную (третью) вакцинацию (например, лица с потенциально ослабленным иммунитетом) из-за небольшого размера выборки (58 человек, получивших бустерные дозы в течение 135 дней после второй вакцинации) и различных историй вакцинации.

Полученные результаты

Большинство людей из пары случай-контроль для инфекций Omicron были в возрасте от 18 до 69 лет и проживали в районах Среднего Гудзона и Столицы. Среди заболевших и контрольной группы 22% и 8% лиц получили повторную вакцинацию соответственно. Соответствующие проценты для непривитых лиц составили 30% и 57% соответственно.

Выборочная популяция для прививок Pfizer, Moderna и Janssen составила 177, 109 и 22 человека соответственно. Инфекции Omicron показали наибольшую связь со статусом первичной вакцинации и ревакцинации со значениями OR 3,1 и 6,7 соответственно. При удалении возраста пациентов в качестве критерия для сопоставления (309 пар случай-контроль) более низкий возраст был прогностическим фактором инфекции Omicron (ОШ 0,96), а значения ОШ для статуса первичной вакцинации (ОШ 4,8) и третьей (бустерной) вакцинации (ОШ 39). ) были больше по сравнению с полученными ранее.

При рассмотрении только вакцинированных лиц (129 пар случай-контроль) вероятность заражения Омикроном снижалась с большей продолжительностью дней, прошедших после самой последней вакцинации (ОШ 0,99). Тенденция к более низким шансам заражения Омикроном после вакцинации Янссеном наблюдалась с пограничной значимостью [ОШ 0,4 по отношению к любой вакцине с использованием матричной рибонуклеиновой кислоты (мРНК)].

Среди пар случай-пациент/контроль для дельта-инфекций (55 пар случай-контроль) большинство людей были в возрасте от 18 до 69 лет (75%) и проживали в районах Лонг-Айленда, Среднего Гудзона и Фингер-Лейкс. 89%). Около 62% и 75% заболевших и контрольной группы были непривиты соответственно. Дельта-инфекции показали наибольшую связь со статусом вакцинации (OR 2.4).

Тип вакцины и количество дней, прошедших с момента последней вакцинации, не показали существенной связи с вероятностью дельта-инфекции. Исключение возраста в качестве критерия соответствия показало, что вероятность заражения дельта-инфекцией была в 7,3 раза выше среди лиц, получивших прививки Pfizer, по сравнению с непривитыми людьми. Шансы также были выше для вакцин Moderna (в 2,0 раза) и вакцин Janssen (в 0,5 раза), хотя по отдельности статистически незначимы.

В целом, результаты исследования показали, что новые штаммы SARS-CoV-2 обладают большим потенциалом, чем ранее циркулирующие штаммы, вызывать инфекции, вызванные прорывом вакцины. Инфекции среди полностью вакцинированных и ревакцинированных лиц были в значительной степени связаны с Омикроном. Однако шансы заразиться Омикроном по сравнению с Дельтой уменьшаются с возрастом. Идентичная, но незначительная тенденция была отмечена в отношении статуса вакцинации во время преобладания дельты.